Faça backup dos seus favoritos clicando no botão de opções do Chrome , em seguida em Favoritos e em Gerenciador de Favoritos ou use o atalho Ctrl+Shift+O.

Agora clique em Organizar e depois em Exportar favoritos para arquivo HTML… Escolha o local para salvar o arquivo.

Para importar os favoritos, basta clicar em Importar favoritos de um arquivo HTML…

Aprenda também: Fazer backup dos favoritos no Firefox